Начиная с 16 лет, воспитанники спартаковской академии начинают выступать в
ЮФЛ, где борятся за самые высокие места. Следующая ступень развития юных спартаковцев — молодежная команда, которая выступает в первенстве МФЛ. Самые лучшие выпускники после молодежки привлекаются к основной команде.
До 2022-го года в структуре "Спартака" была еще одна профессиональная команда — "Спартак-2". Ее задача — дать футболистам игровую практику в профессиональном футболе и подготовить их к выступлению за основную команду.
К сожалению, фарм-клуб расформировали из-за финансовых трудностей, однако есть информация, что в скором времени команда появится вновь.